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  • 資訊 > 市場(chǎng)動(dòng)態(tài) > 我科學(xué)家成功破譯凡納濱對(duì)蝦基因組

    2019-01-26 來(lái)源:食品伙伴網(wǎng)
    中國(guó)科學(xué)院海洋研究所研究員相建海和李富花課題研究組主導(dǎo),與國(guó)內(nèi)外多家單位共同合作,歷時(shí)十年成功破譯了凡納濱對(duì)蝦基因組,獲得了世界上**高質(zhì)量的對(duì)蝦基因組參考圖譜,研究成果1月21日在《自然·通訊》在線發(fā)表,為甲殼動(dòng)物研究及對(duì)蝦基因組育種和分子改良提供了重要理論支撐。

          中國(guó)科學(xué)院海洋研究所研究員相建海和李富花課題研究組主導(dǎo),與國(guó)內(nèi)外多家單位共同合作,歷時(shí)十年成功破譯了凡納濱對(duì)蝦基因組,獲得了世界上高質(zhì)量的對(duì)蝦基因組參考圖譜,研究成果1月21日在《自然·通訊》在線發(fā)表,為甲殼動(dòng)物研究及對(duì)蝦基因組育種和分子改良提供了重要理論支撐。

      甲殼動(dòng)物和昆蟲(chóng)是節(jié)肢動(dòng)物門中的兩大門類,已有超過(guò)6萬(wàn)種甲殼動(dòng)物被報(bào)道。十足目甲殼動(dòng)物囊括了大量重要的水產(chǎn)經(jīng)濟(jì)物種,如蝦、蟹、龍蝦等,而凡納濱對(duì)蝦作為四大養(yǎng)殖蝦類之首,其年產(chǎn)量達(dá)416萬(wàn)噸,具有非常重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。然而,由于種質(zhì)資源匱乏,我國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖單位每年需從國(guó)外引進(jìn)大量親蝦。我國(guó)自主的對(duì)蝦分子遺傳育種工作迫在眉睫,但是受限于沒(méi)有良好的參考基因組,其進(jìn)展一直相對(duì)緩慢。

      對(duì)蝦基因組是世界上公認(rèn)的高復(fù)雜基因組,阻礙了多個(gè)國(guó)際科研機(jī)構(gòu)的研究步伐。在該研究中,科研人員嘗試了從一代到三代的各種測(cè)序平臺(tái)以及各種組裝軟件,最終完成了凡納濱對(duì)蝦的全基因組de novo測(cè)序和組裝,獲得的參考圖譜Scaffold N50達(dá)到606Kb。通過(guò)分析發(fā)現(xiàn),以1-6堿基為單位多次重復(fù)的簡(jiǎn)單串聯(lián)序列(SSR)占對(duì)蝦基因組的23.93%以上,是目前已測(cè)基因組物種中含量的,這也是對(duì)蝦基因組高復(fù)雜性的根本原因,并推測(cè)SSR的爆發(fā)與對(duì)蝦祖先適應(yīng)性進(jìn)化過(guò)程有關(guān)。在對(duì)蝦基因組上還發(fā)現(xiàn)了兩大結(jié)構(gòu)特征:大量的物種特異性基因和大量的串聯(lián)重復(fù)基因,可能與對(duì)蝦科的特異性進(jìn)化有密切聯(lián)系。

      據(jù)介紹,本研究還對(duì)22個(gè)野生和養(yǎng)殖的凡納濱對(duì)蝦個(gè)體進(jìn)行了重測(cè)序,獲得了大量的SNP分子標(biāo)記,為對(duì)蝦的遺傳育種工作提供了寶貴的資源。

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