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  • 資訊 > 市場動態(tài) > 年輕學(xué)者如何開展腸道菌群領(lǐng)域研究?

    2022-05-05 來源:TandF學(xué)術(shù)
    “近年來,中國學(xué)者在腸道菌群研究領(lǐng)域投稿到國際期刊上的論文數(shù)量增加很快,種種跡象都反映出中國在這個領(lǐng)域發(fā)展得非常迅速?!?

       “近年來,中國學(xué)者在腸道菌群研究領(lǐng)域投稿到國際期刊上的論文數(shù)量增加很快,種種跡象都反映出中國在這個領(lǐng)域發(fā)展得非常迅速?!鄙虾=煌ù髮W(xué)趙立平教授近日表示,腸道菌群研究領(lǐng)域在國內(nèi)外的發(fā)展都比較迅速,對在近幾年才開始進入腸道菌群相關(guān)領(lǐng)域開展工作的年輕學(xué)者,趙立平分享了一些經(jīng)驗。

     

      “首先,所有的腸道微生物的研究都必須回答因果關(guān)系問題?!壁w立平解釋道,比如,生病的人和健康的人菌群是不一樣的,但是,是疾病令菌群變得不一樣了,還是因為菌群不一樣讓人得病了?提供相應(yīng)的證據(jù),解釋因果關(guān)系是學(xué)者研究價值的體現(xiàn)之一。學(xué)者在設(shè)計實驗時,對所研究問題的理解不能局限在描述性的層面,不能局限在對一組病人和一組健康人做對比。

     

      在數(shù)據(jù)分析方面,要注意一個新的趨勢——不再參考數(shù)據(jù)庫。趙立平表示,現(xiàn)在通過對DNA進行大規(guī)模測序的技術(shù),可以幫助學(xué)者獲得關(guān)于腸道菌群組成和功能的信息。但是,目前分析數(shù)據(jù)的方法有一個致命的缺點——缺少創(chuàng)新性。

     

      趙立平解釋道,很多學(xué)者分析數(shù)據(jù)時把序列和一個數(shù)據(jù)庫做比較,如果和數(shù)據(jù)庫里已知的東西相似性超過一定的閾值,就給它同一個名字。這個樣品里面也有這個菌,或者也有這個基因,然后把樣品里面的這些能夠定名的基因,或者能夠定名的微生物,全部都定了名之后,再對它進行分析。這樣一來,學(xué)者只能研究別人已經(jīng)研究過的東西,因為數(shù)據(jù)里面肯定有一部分序列屬于從來沒有人研究過的微生物,學(xué)者拿它的DNA序列信息去和數(shù)據(jù)庫比較,那些不能和數(shù)據(jù)庫里的序列足夠像的序列,既不能給名字也不能定功能,按照現(xiàn)在的分析流程,就會被“扔掉”。

     

      “雖然序列數(shù)據(jù)是完整的,但在分析時卻被分成了兩部分,一部分是和別人已經(jīng)研究過的足夠像,能給名字、定功能的序列,這些就可以繼續(xù)往下進行分析。另外一部分,因為是新的數(shù)據(jù),別人沒研究過,所以新學(xué)者也不研究?!壁w立平表示,這樣人為地把真正有創(chuàng)新性的、可能會有新發(fā)現(xiàn)的數(shù)據(jù)丟掉,只研究和別人研究過的東西像的那部分序列,阻礙了研究的創(chuàng)新發(fā)展?!斑@其實是過去十幾年,基于DNA測序數(shù)據(jù)的微生物組研究最致命的缺陷?!壁w立平表示。

     

      “所以,如果是最近才進入這個領(lǐng)域或準(zhǔn)備進入這個領(lǐng)域的年輕學(xué)者,建議不要走老路,不要通過參考別人的數(shù)據(jù)庫來決定分析什么或不分析什么?!壁w立平如是說。

     

      此外,要把生態(tài)學(xué)的概念引入到微生物組或者腸道菌群研究里。趙立平解釋說,因為不同的細(xì)菌,分類地位不一樣,可以合在一起來做一件事情。所以要看哪些細(xì)菌會合作形成一個功能群,影響人或者動物的健康。找對了功能群,找到真正與健康關(guān)系比較密切的、影響比較大的那些菌,進而對其進行的深入研究才有意義。

     

      “對于準(zhǔn)備要進入或者剛剛進入該領(lǐng)域時間不久的學(xué)者,建議不要參考數(shù)據(jù)庫,要從生態(tài)學(xué)的角度,把它當(dāng)成生態(tài)系統(tǒng)去研究,要看誰和誰是一個生態(tài)功能群,而不要因為它是一個屬,或者一個科的細(xì)菌,就把它合在一起進行研究。腸道里面的細(xì)菌不是按照我們對它進行的分類地位來進行活動的,而是按照它們之間的生態(tài)學(xué)關(guān)系進行活動的?!壁w立平表示。

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